Vědci vyvinuli metodu s5PSeq: Odolnost bakterií vůči antibiotikům odhalí během jediného dne

Vědci z Karolinska Institutet vyvinuli rychlou a nákladově efektivní sekvenační metodu nazvanou s5PSeq, která dokáže identifikovat odolnost bakterií vůči antibiotikům během jediného pracovního dne.

Vědci z Karolinska Institutet vyvinuli rychlou a nákladově efektivní sekvenační metodu nazvanou s5PSeq, která dokáže identifikovat odolnost bakterií vůči antibiotikům během jediného pracovního dne. Tato technika měří reakci bakteriálních ribozomů během několika minut po vystavení antibiotiku, což poskytuje molekulární odezvu růstu namísto čekání na výsledky tradičních kultivací.

Metoda s5PSeq se ukázala jako účinná při rozlišování mezi kmeny *Clostridioides difficile* citlivými a odolnými vůči erytromycinu, a to již po pouhých deseti minutách léčby. Detekuje charakteristické „zaseknutí“ v bakteriální RNA, což odhaluje citlivost dlouho předtím, než se objeví jakékoli viditelné rozdíly v růstu. Klíčovou výhodou je její kompatibilita s přenosnými nanopórovými sekvenačními zařízeními, která jsou již běžná v mnoha diagnostických a výzkumných laboratořích. To otevírá možnost integrace rychlého molekulárního testování do běžných klinických postupů.

Vicent Pelechano, vedoucí výzkumník, zdůrazňuje, že rychlejší, fenotypová diagnostika je zásadní pro efektivní řešení antibiotické rezistence. Metoda ukazuje, že spolehlivé molekulární výsledky lze získat v řádu hodin namísto dnů. Vědci nyní pracují na adaptaci s5PSeq pro přímé testování komplexních vzorků pacientů bez předchozí kultivace. Ve spolupráci s Karolinskou univerzitní nemocnicí rozšiřují metodu na další patogeny a antibiotika, aby vyhodnotili její potenciál v reálných klinických podmínkách. Honglian Liu, první autorka studie, dodává, že dalším krokem je pochopit, jak dobře metoda funguje mimo kontrolované laboratorní podmínky, což pomůže určit, jak může s5PSeq podpořit rychlejší a informovanější rozhodnutí o léčbě.