Španělští vědci rozluštili genom houby ničící olivovníky: Otevírají cestu k odolnějším odrůdám
Vědci z Univerzity v Córdobě dosáhli významného průlomu v boji proti chorobě olivovníků známé jako Cercospora leaf spot. Úspěšně se jim podařilo sekvenovat kompletní genom houby *Pseudocercospora cladosporioides*, která tuto chorobu způsobuje.
Vědci z Univerzity v Córdobě dosáhli významného průlomu v boji proti chorobě olivovníků známé jako Cercospora leaf spot. Úspěšně se jim podařilo sekvenovat kompletní genom houby *Pseudocercospora cladosporioides*, která tuto chorobu způsobuje. Toto onemocnění vede k výrazným ztrátám v olivovém průmyslu, které se ročně odhadují až na 50 milionů eur, a projevuje se defoliací a nižšími výnosy.
Choroba Cercospora leaf spot postihuje výhradně olivovníky a divoké olivy. Na horní straně listů se objevují chlorotické skvrny, zatímco na spodní straně listů se tvoří charakteristické olověné zbarvení způsobené plodnicemi houby. Rozšíření náchylných odrůd ve Španělsku, jako je například „Frantoio“, a snížené používání mědi jako preventivního ošetření přispívají k rostoucí prevalenci této choroby. Pro pochopení fungování patogenu a vývoj odolných odrůd je klíčové znát jeho genom, který představuje kompletní „návod k použití“.
Sekvenování genomu bylo dosud obtížné kvůli náročnosti izolace houby mimo hostitele a jejího pěstování v laboratorních podmínkách pro získání vysoce kvalitní DNA a RNA. Díky spolupráci výzkumných týmů z kateder agronomie a genetiky na Univerzitě v Córdobě se nyní podařilo získat a zpřístupnit kompletní genom houby *Pseudocercospora cladosporioides* vědecké komunitě. Kombinací technologií sekvenování DNA s krátkými a dlouhými čteními byl vygenerován genom o velikosti 53 Mb, který identifikoval přes 14 000 genů.
Na základě anotace genomu (procesu identifikace a pochopení genů) bylo možné získat hlubší vhled do infekčních mechanismů houby a její interakce s hostitelem. Bylo identifikováno 491 genů, které se podílejí výhradně na degradaci buněčné stěny olivovníku, což je primární útočný mechanismus houby. Dále byl objeven soubor 434 efektorových proteinů, které působí jako inhibitory obranných mechanismů olivovníku. Tyto poznatky poskytují zásadní nástroj pro šlechtitelské programy zaměřené na vývoj odrůd odolných vůči této chorobě a pro další studium interakcí mezi houbou a olivovníkem. Výzkum byl podpořen programy jako Ramón y Cajal a evropskými projekty, například Gen4olive, což podtrhuje význam mezioborové spolupráce pro řešení komplexních vědeckých problémů. Díky tomuto úsilí má nyní vědecká komunita k dispozici referenční genom, který umožní sledovat vývoj patogenu a vyvíjet lepší nástroje pro dohled a včasnou detekci.