Revoluce ve studiu RNA: Nová databáze poprvé systematicky modeluje klíčové interakce pro zdraví

Vědci z Institutu pro výzkum imunologie a rakoviny na Montrealské univerzitě vyvinuli novou databázi nazvanou RIMap-RISC. Tato platforma integruje molekulární strukturu mikroRNA a messenger RNA (mRNA) s cílem systematicky modelovat jejich vzájemné interakce.

Vědci z Institutu pro výzkum imunologie a rakoviny na Montrealské univerzitě vyvinuli novou databázi nazvanou RIMap-RISC. Tato platforma integruje molekulární strukturu mikroRNA a messenger RNA (mRNA) s cílem systematicky modelovat jejich vzájemné interakce. Databáze, kterou vytvořil doktorand Simon Chasles v laboratoři profesora Françoise Majora, ředitele výzkumné jednotky pro RNA inženýrství IRIC, je podrobně popsána ve studii publikované v časopise _Genome Biology_.

V buňkách se nacházejí různé typy ribonukleových kyselin (RNA). Messenger RNA slouží jako zprostředkovatel genetické informace obsažené v DNA a syntézy proteinů. MikroRNA jsou velmi krátké molekuly, které se zaměřují na messenger RNA, aby je degradovaly nebo inhibovaly, čímž brání překladu určitých genů do proteinů.

Přístup vyvinutý v Majorově laboratoři umožňuje integrovat podrobné strukturní informace o mikroRNA. Tím se posouvá za modely založené pouze na sekvenci mikroRNA a pomáhá pochopit, jak tyto molekuly rozpoznávají messenger RNA a regulují genovou expresi v normálním i patologickém kontextu. Profesor Major zdůraznil, že jde o první systematické modelování tohoto druhu.

Platforma RIMap-RISC je dostupná online a má programovatelné rozhraní. Vědci z IRIC uvádějí, že bude užitečná jak pro základní biologický výzkum, tak pro studium složitých onemocnění, jako je rakovina. Profesor Major dodal, že nový nástroj podpoří opětovné využití dat, jejich integraci do bioinformatických procesů a rozvoj nových přístupů k výzkumu a inovacím v biologii RNA.