Jak geny mění meloun: Nový super-pangenom umožní šlechtit odolnější a chutnější odrůdy

Meloun je neodmyslitelně spjat s létem, vyvolávající představy teplých odpolední a posezení s přáteli. Jeho pruhovaná zelená kůra a růžová dužina, křupavá textura a sladká šťáva jsou výsledkem milionů let přírodního i cíleného šlechtění.

Meloun je neodmyslitelně spjat s létem, vyvolávající představy teplých odpolední a posezení s přáteli. Jeho pruhovaná zelená kůra a růžová dužina, křupavá textura a sladká šťáva jsou výsledkem milionů let přírodního i cíleného šlechtění. Odrůdy, které běžně nacházíme v obchodech, představují jen zlomek celkové rozmanitosti, přičemž každá má jedinečné fyzické vlastnosti dané odlišným genetickým složením.

Historické šlechtění na žádoucí vlastnosti však výrazně snížilo genetickou rozmanitost pěstovaných melounů. To oslabuje jejich schopnost přizpůsobit se změnám prostředí a odolávat chorobám, což ohrožuje jejich dlouhodobou udržitelnost. Divoké odrůdy melounů si naopak zachovaly mnoho cenných vlastností, které by mohly být klíčové pro zlepšení moderních kultivarů.

Mezinárodní tým vědců pod vedením Dr. Zhangjuna Feie z Boyce Thompson Institute proto vytvořil komplexní super-pangenom melounu, který byl nedávno publikován v prestižním časopise Nature Genetics. Tento průlomový zdroj integruje 138 genomů divokých i pěstovaných melounů, což umožňuje bezprecedentně hluboké zobrazení evolučních vztahů mezi jednotlivými genomy.

Tradiční referenční genomy se obvykle odvozují z jediného zástupce druhu a ani běžné pangenomy, které zahrnují více přístupů v rámci jednoho druhu, plně nezachycují rozmanitost napříč příbuznými druhy. Dr. Fei vysvětluje: „Náš pangenom nazýváme super-pangenomem, protože jsme do něj začlenili přístupy nejen z jednoho druhu, ale ze všech sedmi existujících druhů rodu melounu. Divocí příbuzní poskytují bohaté informace pro vývoj markerů a genomickou predikci.“ Super-pangenomy jsou tak výkonnými nástroji pro cílené šlechtění plodin, které lépe odpovídají potřebám společnosti. Tento pokrok otevírá cestu k vývoji odolnějších, výživnějších a chutnějších odrůd melounů, které budou lépe čelit výzvám měnícího se klimatu a nemocem.