Průlom v genetice: Nová metoda sm-PORE-cupine odhaluje, jak tvary RNA ovlivňují zdraví a nemoci

Vědci z A*STAR Genome Institute of Singapore (A*STAR GIS) vyvinuli novou metodu nazvanou „sm-PORE-cupine“, která umožňuje detailně studovat jednotlivé molekuly RNA a odhalit, jak jejich struktury ovlivňují genovou regulaci.

Vědci z A*STAR Genome Institute of Singapore (A*STAR GIS) vyvinuli novou metodu nazvanou „sm-PORE-cupine“, která umožňuje detailně studovat jednotlivé molekuly RNA a odhalit, jak jejich struktury ovlivňují genovou regulaci. Tento základní proces je klíčový pro fungování buněk ve zdraví i při nemoci.

RNA je sice známá především jako nositelka genetických instrukcí z DNA pro tvorbu proteinů, ale její role je mnohem širší. Podobně jako ohebná nit se může RNA ohýbat, skládat a interagovat s jinými molekulami, čímž zaujímá různé tvary. Tyto tvary mají zásadní vliv na efektivitu produkce proteinů, životnost RNA molekul a průběh onemocnění, jako jsou například virové infekce.

Dosud bylo detailní studium těchto struktur obtížné kvůli vysoké flexibilitě a dynamice RNA. Většina stávajících metod poskytovala pouze průměrný obraz napříč mnoha molekulami RNA, což ztěžovalo pozorování, jak se jednotlivé molekuly RNA mohou skládat odlišně, i když pocházejí ze stejného genu.

Tým A*STAR GIS vyvinul technologii „sm-PORE-cupine“ k řešení této výzvy. Kombinuje chemické značení s přímým sekvenováním RNA k detekci změn ve struktuře RNA. Technologie využívá optimalizované chemické sloučeniny k označení nespárovaných RNA bází, což jsou části molekuly, které jsou více exponované. Tyto značky fungují jako ukazatele, které vědcům poskytují vodítka o tom, jak je RNA složena. Následné přímé sekvenování RNA pomocí nanopórů pak čte celé molekuly RNA, což umožňuje detailnější studium jejich struktur.

Díky pokročilé počítačové analýze dokázal tým interpretovat tyto signály s rozlišením na úrovni jednotlivých molekul. To jim pomáhá pochopit, jak se RNA ze stejného genu může skládat a chovat odlišně. Tento průlom otevírá cestu k hlubšímu pochopení toho, jak změny tvaru RNA ovlivňují zdraví a vznik nemocí, a může vést k novým diagnostickým a terapeutickým strategiím.